Investigador principal

Contact

Investigador Principal

Josue Alvarez Borrego

[email protected]

Departamento

Física Aplicada

Posición

Profesor Investigador Titular D

SNII

3

Laboratorio

Óptica

CV Completo

ORCID

CV Resumido

English Translation

ESTUDIOS DE GRADO

• Doctorado en Ciencias especialidad Óptica. CICESE. Ensenada, B.C. Diciembre 1993. Tesis: "Determinación de propiedades estadísticas de superficies rugosas aleatorias a partir de imágenes remotas"

• Estudios de Doctorado en Oceanografía Física. Universidad del Estado de Oregón, EU. 1983-1985

• Maestría en Ciencias especialidad Óptica. CICESE. Ensenada, B.C. Mayo 1983. Tesis: "Análisis óptico de una imagen simulada de la superficie del mar"

• Licenciatura en Oceanografía Física. Escuela Superior de Ciencias Marinas, Universidad Autónoma de Baja California, Ensenada, B.C. Tesis: "Variabilidad espacial y temporal de temperatura en dos lagunas costeras"

EXPERIENCIA EN INVESTIGACIÓN

• Trabajo de tesis de licenciatura, que consistió en analizar varias series de tiempo de temperatura del agua de mar en dos lagunas costeras adyacentes a la costa de Baja California. Por primera vez se determinó con exactitud la variabilidad espacial y temporal de temperatura del agua de mar en esas dos regiones, dándose a conocer los eventos fuertes de surgencia (aguas frias del fondo que salen a la superficie del mar llenándola de altos nutrientes). Con esto fue posible conocer con exactitud cómo es que la región se manifiesta en ciertas épocas del año en una región altamente productiva. Tabajo publicado en la revista Calcofi Report en 1982, actualmente tiene más de 100 citas científicas.

• Trabajo de tesis doctoral que consistió en resolver un problema que se tenía planteado con una antigüedad de 50 años, de poder obtener la estadística de la superficie del mar (del oleaje) mediante la información remota de los patrones de brillo de la superficie del mar. La solución la publicó en la revista Journal of Geophysical Research-Oceans en 1993. Obtiene una función de brillo para el problema unidimensional y para el problema bidimensional. Comprueba que a partir de la imagen fotográfica de los patrones de brillo de la superficie del mar es posible obtener la estadística del oleaje que forma a esa superficie, obteniéndose como resultado el patrón espectral para cada longitud de onda que forma el conjunto de olas de la superfice marina. Esto da la valiosa información de cómo un paquete de olas o varios paquetes de olas pueden ir propagándose sobre la superficie del mar y en un momento dado uno puede saber acerca de la energía que impactará sobre la costa. Publicando todos estos resultados en revistas de alto prestigio como en Optics Communications en 1995, en el Journal of Modern Optics en 1995 y en la Revista Mexicana de Física en 1995

• El desarrollo de algoritmos matemáticos y de sistemas ópticos para detectar de manera automática, en una muestra, especies microscópicas como el fitoplancton (primer eslabón de la cadena alimenticia marina), zooplancton (segundo eslabón de la cadena alimenticia marina). Esto da a lugar el poder identificar de manera muy rápida aguas oceánicas altamente productivas.

• La identificación automática de bacterias como la tuberculosis y a la bacteria que produce el cólera (Vibrio cholerae 01), tan importantes son estos diagnósticos en la prevención de enfermedades de este tipo.

• Identificación de cuerpos de inclusión de virus en tejido de camarón y parásitos de peces, tan importantes en el diagnóstico de enfermedades de camarón y de peces en granjas de cultivo.

• Determinación de pares cromosómicos en especies de abulón y al desarrollo de una nueva metodología para el cálculo de la cantidad de DNA en los cromosomas de diferentes especies. Esto último es de alta relevancia debido a que de esta manera uno puede diferenciar una especie de otra y sobre todo analizar el estado evolutivo de las especies.

• Pionero en el País en el procesamiento de imágenes de partículas biogénicas, como las mencionadas anteriormente.

• Colaborador en artículos científicos con colegas científicos de diferentes partes del mundo.

• Ha dado más de ciento setenta conferencias científicas a nivel nacional e internacional.

• Formador de doctores en ciencia, maestros en ciencia y estudiantes a nivel de licenciatura.

• Múltiples estancias de trabajo en Instituciones en el extranjero como Scripps Institution of Oceanography en la Joya California y en el Consejo Superior de Investigación Científica CSIC en Madrid España y nacionales como Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo CIAD Mazatlán y Facultad de Ingenieria UABC Ensenada.

• Director de varios proyectos científicos apoyados tanto por la Institución donde trabaja como por el CONACYT y el CSIC.

DISTINCIONES Y NOMBRAMIENTOS

• Pertenece al Sistema Nacional de Investigadores en el área de Ciencias Exactas, Nivel 3.

• Premio Internacional BioScienceWorl 2010 otorgado por la IEEE Computer Sociedty.

• Segundo Premio Nacional de Oceanografía en 1994.

• Árbitro de varias revistas internacionales de alto prestigio entre ellas se encuentran: Optical Engineering, Optical Express, Optics Letters, Applied Optics, IEEE International on Geoscience and Remote Sensing, Journal of the Optical Society of America A, Ciencias Marinas, Optics Communications, Optics and Laser in Engineering, Optics and Laser Technology, CICIMAR-Oceanides e Ingenieria Investigación y Tecnología, revista Ingeniería y Ciencia de la Universidad EAFIT, Medellin Colombia. Es parte de la cartera de árbitros del CONACYT y de la University of Alaska Fairbanks, School of Fisheries and Ocean Sciences.

• Nombramiento de Profesor Invitado del Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional Sinaloa del Instituto Politécnico Nacional a partir de 2010.

• Nombramiento de Profesor Invitado de la sección de Estudios de Posgrado e Investigación de la Escuela Superior de Ingeniería, Mecánica y Eléctrica- Unidad Culhuacán. Instituto Politécnico Nacional desde el 25 de Marzo de 2003.

• Evaluador de Cursos de Educación Continua por Invitación de la SEP (Mayo, 2011)

• Jefe del departamento de Óptica del 1 de Noviembre de 1989 al 15 de Junio de 1992 en la División de Física Aplicada del Cicese.

• Miembro de la Academia Mexicana de Ciencias, miembro de la Academia Mexicana de Óptica, miembro de la Unión Geofísica Mexicana entre otras.

• Miembro editor de Open Fish Science Journal, miembro editor de ISRN Machine Vision y Co-Editor del Libro Introducción a la identificación automática de organismos y estructuras microscópicas y macroscópicas.

DISTINCIONES

• General Chair of International Congress RIAO-OPTILAS-MOPM-2019 (https://www.riao.org.mx/optilas_2019/committees.php).

• Co-Chair of Latin America Optics and Photonics (LAOP) 2018, OSA Publishing. https://www.osapublishing.org/conference.cfm?meetingid=117&yr=2018

• President of Academia Mexicana de Óptica (2019-2020).

• Vice-President of Academia Mexicana de Óptica (2017-2018).

• Special Issue Co-Editor in Applied Optics (https://www.osapublishing.org/ao/journal/ao/feature_announce/otpi.cfm).

• Special Issue Co-Editor in Revista Mexicana de Física.

• Member of the Editorial Board of the Journal Investigación y Ciencia de la Universidad Autónoma de Aguascalientes. February 2021 to december 2022.

• Member of the Editorial Board of the Journal of Computer Science and Information Technology

• Member of the Editorial Board of the Journal ScFe Journal of Laser and Optics. 19 May, 2017

• Member of the Editorial Board of the Journal ISRN Machine Vision. http://www.hindawi.com/isrn/mv/editors/

• Member of the Subcommittee of evaluators of Basic Science Area of Physics-Mathematics. Invitation made by Conacyt (April 2011 - ).

• Member of the reviewer’s committee for 2009 IEEE International Symposium on Geoscience and Remote Sensing. http://www.igarss07.org/frontal/Chair3.asp

• Member of the Editorial Board of ‘The Open Fish Science Journal' (ISSN 1874-401X).

http://www.bentham.org/open/tofishsj/EBM.htm 2008-

• Padrino de la Primer Generación de Doctorado en Educación de la Universidad Durango Santander, 2004-2007. Hermosillo Sonora. 16 March, 2007.

• Nombramiento del H. Ayuntamiento de huésped distinguido de la ciudad de Cuernavaca, Mor. por mi participación en la reunión anual de la Unión Geofísica Mexicana, A.C., en November 8 de 1989

• Head of the Optics Department 1o November, 1989 - 15 June, 1992.

• La generación 1985-1988 de la escuela Preparatoria Federal por Cooperación “Benito Juárez”, llevó mi nombre.

• Member of the editorial committe of XI Congreso de Ciencia y Tecnología del Mar 2004 y 2005.

• Nombramiento de Profesor Invitado de la sección de Estudios de Posgrado e Investigación de la Escuela Superior de Ingeniería, Mecánica y Eléctrica- Unidad Culhuacán. Instituto Politécnico Nacional. 25 March, 2003. http://pnpc-ipn-fisicomatematicas.blogspot.com/2008/05/esime-culhuacan-m-en-comunicaciones-y.html

• Member of the editorial committe of proyects of Conacyt, 20 June, 2000-a la fecha.

• Member of the editorial committe of proyects of Conacyt, 20 June, 1999.

• Regular member of Academia Mexicana de Ciencias, 21 September, 1998.

• Treasurer of Unión Geofísica Mexicana a partir November, 1997 a December de 1999.

• Member of Comisión Dictaminadora Interna del Cicese. A partir de February de 1997-2000.

• Member of the external academic committe of the postgraduate degree in sciences in physics of the Escuela de Ciencias Físico-Matemáticas UAS. Since 9 September, 1996.

• Member of the editorial committe of proyects of Conacyt, 20 June, 1996.

• Regular member of Unión Geofísica Mexicana.

• Regular member of Academia Mexicana de Óptica.

• Regular member of Sociedad Mexicana de planctología, April, 1987.

Premios

• SNII, Investigador Nacional Nivel 3, January 01, 2021 - December 31, 2025.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 3, January 01, 2016 - December 31, 2020.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 2, January 01, 2011 – December 31, 2015.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 2, January 01, 2006 - December 31, 2010.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 2, July 01, 2002 – June 30, 2005.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 1, July 01, 1999 – June 30, 2002.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 1, July 01, 1996 - June 30, 1999.

• SNII, Investigador Nacional Nivel 1, July 01, 1993 - June 30, 1996.

• SNII, Candidato a Investigador Nacional, July 01, 1989 – June 30, 1992.

• SNII, Candidato a Investigador Nacional, July 01, 1986 – June 30, 1989.

• BioScienceWorld 2010, IEEE Computer Society.

• Second place in the 1994 National Oceanography contest.

• Senior Researcher D as of January 1, 2002.

• Senior Researcher C as of January 1, 2000.

• Senior Researcher B as of January 1, 1998.

• Senior Researcher A as of January 1, 1990.

Revisor de:

• Applied Optics

• Biomedical Optics Express

• Chinese Optics Letter

• Cicimar Oceanides

• Ciencias Marinas

• Evaluador de cursos de educación contínua. Invitación por la SEP. (May 2011 - ).

• IEEE Access

• IEEE Geosciences and Remote Sensing Letters

• IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing

• Información Tecnológica

• ISRN Machine Vision

• Journal CICIMAR-Oceanides

• Journal Ingeniería Investigación y Tecnología

• Journal Ingeniería y Ciencia de la Universidad EAFIT, Medellin Colombia

• Journal of Electronic Imaging

• Open Fish Science Journal

• Optical Engineering

• Optical Society of America A

• Optics & Laser Technology

• Optics and Lasers in Engineering

• Optics Communications

• Optics Express

• Optics Letter

• Pattern Recognition Letters

• Proposal of University of Alaska Fairbanks, School of Fisheries and Ocean Sciences

• Revista de Ingeniería y Ciencia.

Los artículos que he publicado han sido citados en países como:

• México
• Estados Unidos
• Bermudas
• Colombia
• Brasil
• Chile
• Argentina
• Suecia
• Reino Unido
• Finlandia
• Rusia
• Kazajistán
• Lituania
• Ucrania
• Países Bajos
• Francia
• Suiza
• República Checa
• Hungría
• Eslovenia
• Italia
• Grecia
• España
• Portugal
• Bulgaria
• Alemania
• Irlanda
• Austria
• Polonia
• Turquía
• Irán
• Israel
• Jordania
• Arabia Saudita
• Emiratos Árabes Unidos
• Afganistán
• India
• Sri Lanka
• Bangladesh
• Tailandia
• China
• Corea del Sur
• Japón
• Taiwán
• Filipinas
• Malasia
• Singapur
• Indonesia
• Australia
• Nueva Zelanda
• Sudáfrica
• Noruega

Obtenido de Web of Sciences-Publons. Esto habla del impacto internacional de mi trabajo.*

He publicado artículos rigurosamente arbitrados en 38 revistas diferentes, las cuales son:

• Applied Sciences
• IEEE Access
• Journal of Signal Processing Systems
• Applied Optics
• International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence
• Biomedical Optics Express
• IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing
• Ukranian Journal of Physical Optics
• Journal of Modern Optics
• OPTIK International Journal for Light and Electron Optics
• Optics Communication
• Revista Cubana de Física
• Optical Engineering
• Gayana
• IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters
• Aquaculture
• International Journal on Advances in Life Sciences
• Hidrobiológica
• Digital Scientific and Technological Journal
• Research in Computing Science
• Biological Research
• Pattern Recognition and Image Analysis
• Optical Memory & Neural Networks
• Revista de Biología Marina y Oceanografía
• Journal of Shellfish Research
• Hereditas
• IEICE Transactions on Fundamentals of Electronics, Communications and Computer Sciences
• Marine Ecology
• Journal of Plankton Research
• Crustaceana
• Limnetica
• Marine Biology
• Ciencias Marinas
• Revista Mexicana de Física
• Journal Geophysical Research-Oceans
• Óptica
• Revista Óptica Pura y Aplicada
• Calcofi Report

He publicado artículos en actas de congresos en 31 Actas diferentes, las cuales son:

• SPIE Proceedings
• AIP Proceedings
• Mexican Optics and Photonic Meeting Proceedings
• Latin American Optics and Photonics Proceedings
• International Conference in Optics Proceedings
• Memoria de la XXIV Semana de Investigación y Docencia en Matemáticas
• CICOMP Proceedings
• IACSIT París Proceedings
• Iberoamerican Optics Meeting and 11th Latin American Meeting in Optics, Lasers and Applications
• IEEE IGARSS Proceedings
• ICO Proceedings
• VI Semana Nacional de Ingeniería Electrónica Proceedings
• BiosScienceWorld Proceedings
• Congreso Nacional de Física Proceedings
• CONCIBE Proceedings
• Symposium Optics in Industry Proceedings
• CIARP Proceedings
• World Aquaculture Proceedings
• International Conference on Optics
• Biomedical Optics Proceedings
• Iberian Conference on Pattern Recognition and Image Analysis Proceedings
• International Optical Congress ¨Optics-XXI Century¨ Proceedings
• III International Conference ¨Basic Problems of Optics¨
• Topical Meeting on Optoinformatics Proceedings
• International Conference on Pattern Recognitionand Image Analysis: New Information Technologies (PRIA-7-2004) Proceedings
• Progress in Pattern Recognition, Speechn and Image Analysis Proceedings
• Lecture Notes on Computer Sciences
• International Workshop ¨Optics in Computing-St.Petersburg¨ Proceedings
• International Conference ¨Pattern Recognition and Image Analysis: New Information Technologies, Proceedings
• International Symposium on Optical Science and Technology Proceedings
• Electronic Imaging Proceedings
• IEEE-EUROSIP Workshop on Nonlinear Signal and Image Processing, Image Smoothing and Enhancement, Proceedings
• Proceedings Natural and Man-Made Coastal Hazards